20世紀(jì)80年代前，醫(yī)藥行政管理是一個(gè)分別由石化、商業(yè)、輕工、科技、衛(wèi)生等分散、多頭管理的系統(tǒng)。1980年6月，隨著醫(yī)藥行政管理體制的改革，廣西成立了自治區(qū)醫(yī)藥管理局，藥品有了專(zhuān)門(mén)的醫(yī)藥行業(yè)管理和衛(wèi)生行政部門(mén)的質(zhì)量監(jiān)督管理部門(mén)。1998年，根據(jù)《關(guān)于機(jī)構(gòu)設(shè)置的通知》精神，國(guó)家藥品監(jiān)督管理局組建。2000年9月，根據(jù)中央和廣西體制改革精神和機(jī)構(gòu)設(shè)置方案，廣西撤銷(xiāo)了自治區(qū)醫(yī)藥管理局，組建成立了自治區(qū)藥品監(jiān)督管理局，為自治區(qū)直屬的主管藥品監(jiān)督管理的行政執(zhí)法機(jī)構(gòu)，主管藥品監(jiān)督管理工作，實(shí)行自治區(qū)以下垂直管理體制。2004年，組建食品藥品監(jiān)督管理部門(mén)，在原有職能的基礎(chǔ)上，增加對(duì)食品的綜合協(xié)調(diào)管理和化妝品、保健品的審批管理。2009年5月，為適應(yīng)《食品法》對(duì)部門(mén)監(jiān)管職責(zé)調(diào)整的需要，食品藥品監(jiān)管部門(mén)承接由原衛(wèi)生部門(mén)承擔(dān)的餐飲服務(wù)食品監(jiān)管職責(zé)，將綜合協(xié)調(diào)食品、組織查處食品重大事故的職責(zé)劃給衛(wèi)生部門(mén)；2010年，我區(qū)將食品藥品監(jiān)督管理體制調(diào)整為市、縣政府分級(jí)管理，食品藥品監(jiān)管部門(mén)增加了保健食品、化妝品監(jiān)管職責(zé)。自治區(qū)食品藥品監(jiān)督管理局由政府直屬機(jī)構(gòu)調(diào)整為部門(mén)管理，機(jī)構(gòu)規(guī)格為保留正廳級(jí)作為過(guò)渡，人、財(cái)、物管理渠道不變；市、縣食品藥品監(jiān)督管理局獨(dú)立設(shè)置、作為政府工作部門(mén)。